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    1. CCRC-HaunerDE
    2. Labore
    3. Kotlarz Lab

    Kotlarz Lab

    Decoding disease signatures of Pediatric IBD - A system biology-driven approach

    • Forschungsgebiet

      • Genetic signatures in pediatric inflammatory bowel disease
      • Transcriptional networks in pediatric inflammatory bowel disease
      • Mucosal Immunology 
      • Preclinical Models of inflammatory bowel disease

      Dr. med. Daniel Kotlarz, PhD 

      ✉   daniel.kotlarz@med.uni-muenchen.de

      ☎  +49-89-4400-53123

    • Mehr Informationen zu unserer Forschung finden Sie auf unserer englischen Website.

    • Jonas Bibus

      Jonas Bibus, M.Sc.

      Doctoral Researcher (PhD track)

      ✉ Jonas Bibus

      ☎ 089-4400-57985, Room: K0.02

      Alina Hundt

      Alina Hundt

      Doctoral Researcher (MD)

      ✉ Alina Hundt

      Room: K0.01

      Natsuki Ito

      Dr. med. Natsuki Ito 

      Research Fellow

      ✉ Natsuki Ito

      Room: K0.01

      Yuhan Jia

      Yuhan Jia

      Bioinformatician 

      ✉ Jia Yuhan

      Waltherstraße 23

      Marina Kreuzeder

      Marina Kreuzeder, PhD

      Scientific Project Manager

      ✉ Marina Kreuzeder

      ☎ 089-4400-57359, Room: K0.07

      Jiahui Ma

      Jiahui Ma

      Doctoral Researcher (PhD)

      ✉ Jiahui Ma

      Room: K0.01

      Xiang Shen

      Xiang Shen, M.Sc.

      Doctoral Researcher (PhD track)

      ✉ Xiang Shen

      ☎ 089-4400-57980, Room: K0.13

      Jorge Vincentelli

      Jorge Vincentelli

      Doctoral Researcher (PhD track)

      ✉ Jorge Vincentelli

      ☎ 089-4400-57980

      Wing Yin Yeung

      Wing Yin Yeung, M.Sc. 

      Doctoral Researcher (PhD track)

      ✉ Wing Yeung

      ☎ 089-4400-57980, Room: K0.01

       Madleen Biggel

      Madleen Biggel, M.Sc. 

      Doctoral Researcher (PhD track)

      ✉ madleen biggel

      ☎ 089-4400-57980, Room: K0.01


      David Illig

      David Illig, PhD.

      Post-Doc

      ✉ David Illig

      ☎ 089-4400-57985, Room: K0.02

      Daniel Kotlarz

      Dr. med. Daniel Kotlarz, PhD 

      Principal Investigator

      ✉ Daniel Kotlarz

      ☎ 089-4400-57984, Room: K0.05

      Christopher Lance

      Christopher Lance, M.Sc. 

      Doctoral Researcher (PhD track)

      Co-advised with Prof. Dr. Fabian Theis

      ✉ Christopher Lance, Room: K0.25

      Mina Pellegrini

      Mina Pellegrini, PhD

      Research assistant

      ✉ Mina Pellegrini

      ☎ 089-4400-57980, Room: K0.01

      Zeynep Ünal

      Zeynep Ünal, M.Sc. 

      Doctoral Researcher (PhD track)

      ✉ Zeynep Uenal

      ☎ 089-4400-57980, Room: K0.01

      Benjamin Weinert

      Benjamin Weinert, M.Sc.

      Doctoral Researcher (PhD track)

      Co-supervised by Dr. C. Marr

      ✉ Benjamin Weinert

      Helmholtz Institute

      Zhengyuan Xue

      Zhengyuan Xue, M.Sc. 

      Doctoral Researcher (PhD track)

      Co-advised with Prof. Dr. Fabian Theis

      ✉ Zhengyuan Xue

      Room: K0.25

      Ziqi Yu

      Ziqi Yu

      Doctoral Researcher (PhD track)

      ✉ Ziqi Yu

      ☎ 089-4400-57980, Room: K0.01

    • Ausgewählte Publikationen

      Valosin-containing protein-regulated endoplasmic reticulum stress causes NOD2-dependent inflammatory responses. Ghalandary M, Li Y, Fröhlich T, Magg T, Liu Y, Rohlfs M, Hollizeck S, Conca R, Schwerd T, Uhlig HH, Bufler P, Koletzko S, Muise AM, Snapper SB, Hauck F, Klein C, Kotlarz D (2022). Sci Rep 12, 3906.

      Human RIPK1 deficiency causes combined immunodeficiency and inflammatory bowel diseases.
      Li Y, Fuhrer M, Bahrami E, Socha P, Klaudel-Dreszler M, Bouzidi A, Liu Y, Lehle AS, Magg T, Hollizeck S, Rohlfs M, Conca R, Field M, Warner N, Mordechai S, Shteyer E, Turner D, Boukari R, Belbouab R, Walz C, Gaidt MM, Hornung V, Baumann B, Pannicke U, Al Idrissi E, Ali Alghamdi H, Sepulveda FE, Gil M, de Saint Basile G, Honig M, Koletzko S, Muise AM, Snapper SB, Schwarz K, Klein C, and Kotlarz D (2019). Proc Natl Acad Sci U S A 116, 970-975.

      Intestinal Inflammation and Dysregulated Immunity in Patients With Inherited Caspase-8 Deficiency.
      Lehle AS, Farin HF, Marquardt B, Michels BE, Magg T, Li Y, Liu Y, Ghalandary M, Lammens K, Hollizeck S, Rohlfs M, Hauck F, Conca R, Walz C, Weiss B, Lev A, Simon AJ, Gross O, Gaidt MM, Hornung V, Clevers H, Yazbeck N, Hanna-Wakim R, Shouval DS, Warner N, Somech R, Muise AM, Snapper SB, Bufler P, Koletzko S, Klein C, and Kotlarz D (2019). Gastroenterology 156, 275-278.

      Human TGF-beta1 deficiency causes severe inflammatory bowel disease and encephalopathy.
      Kotlarz D, Marquardt B, Baroy T, Lee WS, Konnikova L, Hollizeck S, Magg T, Lehle AS, Walz C, Borggraefe I, Hauck F, Bufler P, Conca R, Wall SM, Schumacher EM, Misceo D, Frengen E, Bentsen BS, Uhlig HH, Hopfner KP, Muise AM, Snapper SB, Stromme P, and Klein C (2018). Nat Genet 50, 344-348.

      Loss-of-function mutations in the IL-21 receptor gene cause a primary immunodeficiency syndrome.
      Kotlarz D, Zietara N, Uzel G, Weidemann T, Braun CJ, Diestelhorst J, Krawitz PM, Robinson PN, Hecht J, Puchalka J, Gertz EM, Schaffer AA, Lawrence MG, Kardava L, Pfeifer D, Baumann U, Pfister ED, Hanson EP, Schambach A, Jacobs R, Kreipe H, Moir S, Milner JD, Schwille P, Mundlos S, and Klein C (2013). J Exp Med 210, 433-443.

      Loss of interleukin-10 signaling and infantile inflammatory bowel disease: implications for diagnosis and therapy.
      Kotlarz D, Beier R, Murugan D, Diestelhorst J, Jensen O, Boztug K, Pfeifer D, Kreipe H, Pfister ED, Baumann U, Puchalka J, Bohne J, Egritas O, Dalgic B, Kolho KL, Sauerbrey A, Buderus S, Gungor T, Enninger A, Koda YK, Guariso G, Weiss B, Corbacioglu S, Socha P, Uslu N, Metin A, Wahbeh GT, Husain K, Ramadan D, Al-Herz W, Grimbacher B, Sauer M, Sykora KW, Koletzko S, and Klein C (2012). Gastroenterology 143, 347-355.

      Inflammatory bowel disease and mutations affecting the interleukin-10 receptor.
      Glocker EO, Kotlarz D, Boztug K, Gertz EM, Schaffer AA, Noyan F, Perro M, Diestelhorst J, Allroth A, Murugan D, Hatscher N, Pfeifer D, Sykora KW, Sauer M, Kreipe H, Lacher M, Nustede R, Woellner C, Baumann U, Salzer U, Koletzko S, Shah N, Segal AW, Sauerbrey A, Buderus S, Snapper SB, Grimbacher B, and Klein C (2009). N Engl J Med 361, 2033-2045.


      Please refer to the complete list of published work in my bibliography.


    • Wir suchen kontinuierlich nach motivierten Mitarbeiter*innen für unsere Forschungsgruppe. 

      - Studentierende (Bachelor / Master),

      - Promovierende

      - insbesondere in den Feldern Life Science und Bioinformatik

      Falls du interessiert bist, bitte sende deine Bewerbung (inkl. Lebenslauf, Motivationsschreiben und Referenzen) per E-mail an Daniel Kotlarz.

    • Mehr Informationen zu unserer Forschung finden Sie auf unserer englischen Website.

    • Kotlarz Lab


      Kinderklinik und Kinderpoliklinik im Dr. von Haunerschen Kinderspital,

      Klinikum der Universität München, LMU München

      Postadresse:  

      Lindwurmstr. 4

      80337 München

      Deutschland

      Telefon: +49 89 4400 57980

      Shipment of patient samples (please contact via Email prior to shipment):

      Dr. von Haunerschen Kinderspital

      Forschungszentrum KUBUS

      AG Klein

      Lindwurmstr. 2a

      D-80337 Munich

      Germany

      Phone: +49 (0)89 - 4400 - 57985

    Forschung im CCRC Hauner

    Kontakt LMU Klinikum

    Kontakt CCRC Hauner

    CCRC Hauner - Comprehensive Childhood Research Center 

    Kinderklinik und Kinderpoliklinik

    im Dr. von Haunerschen Kinderspital

    Ludwig Maximilians Universität München

    Lindwurmstr. 4

    80337 Munich, Germany


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