Kotlarz Lab
Decoding disease signatures of Pediatric IBD - A system biology-driven approach
Prof. Dr. med. Daniel Kotlarz, PhD
Professor für Präzisionsmedizin entzündlicher Darmerkrankungen im Kindesalter
Forschungsgebiet
- Genetic signatures in pediatric inflammatory bowel disease
- Transcriptional networks in pediatric inflammatory bowel disease
- Mucosal Immunology
Preclinical Models of inflammatory bowel disease
Für Infos zu unserer Bioinformatik besuchen sie auch unsere Helmholtz Website:
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November 2025
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September 2023
März 2022
Mai 2021
März 2021
März 2020
Mehr Informationen zu unserer Forschung finden Sie auf unserer englischen Website.
Christopher Lance, M.Sc.
Doctoral Researcher (PhD track)
Co-advised with Prof. Dr. Fabian Theis
Helmholtz Institute
Zhengyuan Xue, M.Sc.
Doctoral Researcher (PhD track)
Co-advised with Prof. Dr. Dr. E. Zeggini & Dr. F. P. Casale
Helmholtz Institute
Dr. med. Natsuki Ito
Gastwissenschaftler
Benjamin Weinert, M.Sc.
Doctoral Researcher (PhD track)
Co-advised by Dr. C. Marr
Helmholtz Institute
Ausgewählte Publikationen
Valosin-containing protein-regulated endoplasmic reticulum stress causes NOD2-dependent inflammatory responses. Ghalandary M, Li Y, Fröhlich T, Magg T, Liu Y, Rohlfs M, Hollizeck S, Conca R, Schwerd T, Uhlig HH, Bufler P, Koletzko S, Muise AM, Snapper SB, Hauck F, Klein C, Kotlarz D (2022). Sci Rep 12, 3906.
Human RIPK1 deficiency causes combined immunodeficiency and inflammatory bowel diseases.
Li Y, Fuhrer M, Bahrami E, Socha P, Klaudel-Dreszler M, Bouzidi A, Liu Y, Lehle AS, Magg T, Hollizeck S, Rohlfs M, Conca R, Field M, Warner N, Mordechai S, Shteyer E, Turner D, Boukari R, Belbouab R, Walz C, Gaidt MM, Hornung V, Baumann B, Pannicke U, Al Idrissi E, Ali Alghamdi H, Sepulveda FE, Gil M, de Saint Basile G, Honig M, Koletzko S, Muise AM, Snapper SB, Schwarz K, Klein C, and Kotlarz D (2019). Proc Natl Acad Sci U S A 116, 970-975.
Intestinal Inflammation and Dysregulated Immunity in Patients With Inherited Caspase-8 Deficiency.
Lehle AS, Farin HF, Marquardt B, Michels BE, Magg T, Li Y, Liu Y, Ghalandary M, Lammens K, Hollizeck S, Rohlfs M, Hauck F, Conca R, Walz C, Weiss B, Lev A, Simon AJ, Gross O, Gaidt MM, Hornung V, Clevers H, Yazbeck N, Hanna-Wakim R, Shouval DS, Warner N, Somech R, Muise AM, Snapper SB, Bufler P, Koletzko S, Klein C, and Kotlarz D (2019). Gastroenterology 156, 275-278.
Human TGF-beta1 deficiency causes severe inflammatory bowel disease and encephalopathy.
Kotlarz D, Marquardt B, Baroy T, Lee WS, Konnikova L, Hollizeck S, Magg T, Lehle AS, Walz C, Borggraefe I, Hauck F, Bufler P, Conca R, Wall SM, Schumacher EM, Misceo D, Frengen E, Bentsen BS, Uhlig HH, Hopfner KP, Muise AM, Snapper SB, Stromme P, and Klein C (2018). Nat Genet 50, 344-348.
Loss-of-function mutations in the IL-21 receptor gene cause a primary immunodeficiency syndrome.
Kotlarz D, Zietara N, Uzel G, Weidemann T, Braun CJ, Diestelhorst J, Krawitz PM, Robinson PN, Hecht J, Puchalka J, Gertz EM, Schaffer AA, Lawrence MG, Kardava L, Pfeifer D, Baumann U, Pfister ED, Hanson EP, Schambach A, Jacobs R, Kreipe H, Moir S, Milner JD, Schwille P, Mundlos S, and Klein C (2013). J Exp Med 210, 433-443.
Loss of interleukin-10 signaling and infantile inflammatory bowel disease: implications for diagnosis and therapy.
Kotlarz D, Beier R, Murugan D, Diestelhorst J, Jensen O, Boztug K, Pfeifer D, Kreipe H, Pfister ED, Baumann U, Puchalka J, Bohne J, Egritas O, Dalgic B, Kolho KL, Sauerbrey A, Buderus S, Gungor T, Enninger A, Koda YK, Guariso G, Weiss B, Corbacioglu S, Socha P, Uslu N, Metin A, Wahbeh GT, Husain K, Ramadan D, Al-Herz W, Grimbacher B, Sauer M, Sykora KW, Koletzko S, and Klein C (2012). Gastroenterology 143, 347-355.
Inflammatory bowel disease and mutations affecting the interleukin-10 receptor.
Glocker EO, Kotlarz D, Boztug K, Gertz EM, Schaffer AA, Noyan F, Perro M, Diestelhorst J, Allroth A, Murugan D, Hatscher N, Pfeifer D, Sykora KW, Sauer M, Kreipe H, Lacher M, Nustede R, Woellner C, Baumann U, Salzer U, Koletzko S, Shah N, Segal AW, Sauerbrey A, Buderus S, Snapper SB, Grimbacher B, and Klein C (2009). N Engl J Med 361, 2033-2045.
Please refer to the complete list of published work in my bibliography.
VEO-IBD Consortium Meeting Azores (2026)
PIBD Tokyo (2026)
KRF Innovations Symposium Honolulu (2025)
ECCO Berlin (2025)
KRF Innovations Symposium San Francisco (2024)
VEO-IBD Consortium Meeting Oxford (2024)
Midwinter Conference Seefeld (2024)
VEO-IBD Consortium Meeting Salzburg (2023)
ECCO Copenhagen (2023)
VEO-IBD Consortium Meeting Toronto (2022)
IRTG1054 Retreat Venice (2022)
“The Great Holiday Lab Quest!” 🔍✨ (2025)
Farewell Natsuki (2025)
Scientific Retreat (2025)
Chinese Hotpot Christmas (2024)
Retreat Salzburg (2024)
Lab visit Aleixo Muise (2023)
Retreat Nesselwang (2023)
Retreat Regensburg (2022)
Außerdem suchen wir kontinuierlich nach motivierten Mitarbeiter*innen für unsere Forschungsgruppe.
- Studentierende (Bachelor / Master),
- Promovierende
- insbesondere in den Feldern Life Science und Bioinformatik
Falls du interessiert bist, bitte sende deine Bewerbung (inkl. Lebenslauf, Motivationsschreiben und Referenzen) per E-mail an Daniel Kotlarz.
Kotlarz Lab
Kinderklinik und Kinderpoliklinik im Dr. von Haunerschen Kinderspital,
Klinikum der Universität München, LMU München
Postadresse:
Lindwurmstr. 4
80337 München
Deutschland
Telefon: +49 89 4400 57980
Shipment of patient samples (please contact via Email prior to shipment):
Dr. von Haunerschen Kinderspital
Forschungszentrum KUBUS
AG Klein
Lindwurmstr. 2a
D-80337 Munich
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